Protéines de la famille ubiquitine et régulation de la croissance cellulaire

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La famille Ubiquitine durant la réponse aux stress cellulaires

L’Ubiquitine et ses molécules apparentées telles que SUMO et NEDD8 représentent une famille de petites protéines qui contrôlent une grande variété de processus biologiques, comme la destruction des protéines, la régulation de l’activité transcriptionnelle, la localisation subcellulaire, la réparation de l’ADN, l’endocytose, la signalisation cellulaire ou l’autophagie. Cette immense diversité fonctionnelle réside dans l’aptitude de cette famille de protéines à modifier de façon covalente d’autres protéines et ainsi modifier leur fonction. Cette famille de protéines présente une grande pertinence médicale comme l’atteste leur implication comme cible thérapeutique dans le traitement de certains cancers. Il est donc primordial de comprendre leur rôle au sein des voies de signalisation cellulaire et en condition pathologique. Notre recherche se concentre notamment sur la protéine NEDD8 qui est indispensable à la viabilité et la croissance cellulaire ainsi qu’au développement. Notre but est d’identifier les cibles protéiques de NEDD8 et de comprendre comment la voie d’activation de NEDD8 est contrôlée, et tout particulièrement en réponse aux stress cellulaires. Pour ce faire, nous combinons une variété d’approches biochimiques et biologiques, notamment la protéomique quantitative ainsi que la génétique moléculaire. Sachant que certains inhibiteurs de la voie NEDD8 sont d’ores et déjà en cours d’essais cliniques pour le traitement du cancer, nous pensons que nos recherches aiderons à utiliser au mieux ces nouveaux agents thérapeutiques.

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Dimitris Xirodimas

Membres de l'équipe

  • Aymeric BAILLY
    (CRCN) +33 (0)4 34 35 95 34
  • Lorene BRUNELLO
    (Doctorant) +33 (0)4 34 35 95 34
  • Igor MESZKA
    (Doctorant) +33 (0)4 34 35 95 34
  • Dimitra MITSIADOU
    (Stagiaire) +33 (0)4 34 35 95 35
  • Jolanta POLANOWSKA
    (CRCN) +33 (0)4 34 35 95 33
  • Helene TRAUCHESSEC
    (AI-Recherche) +33 (0)4 34 35 95 33
  • Dimitris XIRODIMAS Chef d'equipe
    (Chercheur DR2) +33 (0)4 34 35 95 33
    • 2019

      The balance between Mono- and NEDD8-Chains Controlled by NEDP1 upon DNA Damage Is a Regulatory Module of the HSP70 ATPase Activity.

      Bailly AP, Perrin A, Serrano-Macia M, Maghames C, Leidecker O, Trauchessec H, Martinez-Chantar ML, Gartner A, Xirodimas DP.

      Cell Rep. 29(1):212-224 Pubmed

    • 2018

      NEDDylation promotes nuclear protein aggregation and protects the Ubiquitin Proteasome System upon proteotoxic stress.

      Maghames CM, Lobato-Gil S, Perrin A, Trauchessec H, Rodriguez MS, Urbach S, Marin P, Xirodimas DP.

      Nat Commun. 9(1):4376. Pubmed

    • 2018

      Interplay between SUMOylation and NEDDylation regulates RPL11 localization and function.

      El Motiam A, Vidal S, de la Cruz-Herrera CF, Da Silva-Álvarez S, Baz-Martínez M, Seoane R, Vidal A, Rodríguez MS,[...]

      FASEB J. :fj201800341RR Pubmed

    • 2017

      Quantitative FLIM-FRET Microscopy to Monitor Nanoscale Chromatin Compaction In Vivo Reveals Structural Roles of Condensin Complexes.

      Llères D, Bailly AP, Perrin A, Norman DG, Xirodimas DP, Feil R.

      Cell Rep. 18:1791-1803. Pubmed

    • 2016

      The use of the NEDD8 inhibitor MLN4924 (Pevonedistat) in a cyclotherapy approach to protect wild-type p53 cells from MLN4924 induced toxicity.

      Malhab LJ, Descamps S, Delaval B, Xirodimas DP.

      Sci Rep. 6:37775. Pubmed

    • 2016

      The NEDD8 inhibitor MLN4924 increases the size of the nucleolus and activates p53 through the ribosomal-Mdm2 pathway.

      Bailly A, Perrin A, Bou Malhab LJ, Pion E, Larance M, Nagala M, Smith P, O'Donohue MF, Gleizes PE, Zomerdijk[...]

      Oncogene. 35:415-26. Pubmed

    • 2015

      PKA-dependent phosphorylation of ribosomal protein S6 does not correlate with translation efficiency in striatonigral and striatopallidal medium-sized spiny neurons.

      Biever A, Puighermanal E, Nishi A, David A, Panciatici C, Longueville S, Xirodimas D, Gangarossa G, Meyuhas O, Hervé D,[...]

      J Neurosci. 35:4113-30. Pubmed

    • 2015

      Regulation of cancer-related pathways by protein NEDDylation and strategies for the use of NEDD8 inhibitors in the clinic.

      Abidi N, Xirodimas DP.

      Endocr Relat Cancer. 22:T55-70. Pubmed

    • 2013

      DNA-binding regulates site-specific ubiquitination of IRF-1.

      Landré V, Pion E, Narayan V, Xirodimas DP, Ball KL.

      Biochem J. 449(3):707-17. Pubmed

    • 2013

      DUBs « found in translation »: USP15 controls stability of newly synthesized REST.

      Xirodimas DP.

      Cell Cycle. 12(16):2536-7. Pubmed

    • 2012

      Characterization of MRFAP1 turnover and interactions downstream of the NEDD8 pathway.

      Larance M, Kirkwood KJ, Xirodimas DP, Lundberg E, Uhlen M, Lamond AI.

      Mol Cell Proteomics. 11(3):M111.014407. Pubmed

    • 2012

      Murine double minute 2 regulates Hu antigen R stability in human liver and colon cancer through NEDDylation.

      Embade N, Fernández-Ramos D, Varela-Rey M, Beraza N, Sini M, Gutiérrez de Juan V, Woodhoo A, Martínez-López N, Rodríguez-Iruretagoyena B,[...]

      Hepatology. 55(4):1237-48. Pubmed

    • 2012

      Isolation of NEDDylated proteins in human cells.

      Leidecker O, Xirodimas DP.

      Methods Mol Biol. 832:133-40. Pubmed

    • 2012

      The ubiquitin E1 enzyme Ube1 mediates NEDD8 activation under diverse stress conditions.

      Leidecker O, Matic I, Mahata B, Pion E, Xirodimas DP.

      Cell Cycle. 11(6):1142-50. Pubmed

    • 2012

      The p53 isoforms are differentially modified by Mdm2.

      Camus S, Ménendez S, Fernandes K, Kua N, Liu G, Xirodimas DP, Lane DP, Bourdon JC.

      Cell Cycle.11(8):1646-55. Pubmed

    • 2012

      Influence of the nuclear membrane, active transport, and cell shape on the Hes1 and p53-Mdm2 pathways: insights from spatio-temporal modelling.

      Sturrock M, Terry AJ, Xirodimas DP, Thompson AM, Chaplain MA.

      Bull Math Biol. 74(7):1531-79. Pubmed

    • 2011

      Spatio-temporal modelling of the Hes1 and p53-Mdm2 intracellular signalling pathways.

      Sturrock M, Terry AJ, Xirodimas DP, Thompson AM, Chaplain MA.

      J Theor Biol. 273(1):15-31. Pubmed

    • 2011

      The essential functions of NEDD8 are mediated via distinct surface regions, and not by polyneddylation in Schizosaccharomyces pombe.

      Girdwood D, Xirodimas DP, Gordon C.

      PLoS One. 6(5):e20089. Pubmed

    • 2011

      In the family with ubiquitin.

      Alexandru G, Pariente N, Xirodimas D.

      EMBO Rep. 12(9):880-2. Pubmed

    • 2011

      Stable-isotope labeling with amino acids in nematodes.

      Larance M, Bailly AP, Pourkarimi E, Hay RT, Buchanan G, Coulthurst S, Xirodimas DP, Gartner A, Lamond AI.

      Nat Methods. 8(10):849-51. Pubmed

    • 2010

      Perturbation of 60 S ribosomal biogenesis results in ribosomal protein L5- and L11-dependent p53 activation.

      Sun XX, Wang YG, Xirodimas DP, Dai MS.

      J Biol Chem. 285(33):25812-21. Pubmed

    • 2010

      Mechanism of hypoxia-induced NF-kappaB.

      Culver C, Sundqvist A, Mudie S, Melvin A, Xirodimas D, Rocha S.

      Mol Cell Biol. 30(20):4901-21. Pubmed

    • 2010

      Ubiquitin Family Members in the Regulation of the Tumor Suppressor p53.

      Xirodimas DP, Scheffner M.

      Subcell Biochem. 54:116-35. Pubmed

    • 2009

      Regulation of nucleolar signalling to p53 through NEDDylation of L11.

      Sundqvist A, Liu G, Mirsaliotis A, Xirodimas DP.

      EMBO Rep. 10(10):1132-9. Pubmed

    • 2009

      Detection of protein SUMOylation in vivo.

      Tatham MH, Rodriguez MS, Xirodimas DP, Hay RT.

      Nat Protoc. 4(9):1363-71. Pubmed

    • 2008

      Ribosomal proteins are targets for the NEDD8 pathway.

      Xirodimas DP, Sundqvist A, Nakamura A, Shen L, Botting C, Hay RT.

      EMBO Rep. 9(3):280-6. Pubmed

    • 2008

      Much to know about proteolysis: intricate proteolytic machineries compromise essential cellular functions.

      Marfany G, Farràs R, Salido E, Xirodimas DP, Rodríguez MS.

      Biochem Soc Trans. 36(Pt 5):781-5. Pubmed

    • 2008

      Novel substrates and functions for the ubiquitin-like molecule NEDD8.

      Xirodimas DP.

      Biochem Soc Trans. 36(Pt 5):802-6. Pubmed