Notre recherche

Les cellules eucaryotes sont composées de milliers d’espèces lipidiques différentes. Les lipides remplissent des fonctions essentielles et variées, en servant aussi bien d’éléments constitutifs des membranes, de molécules de signalisation ou de réserve énergétique. Après leur synthèse, les lipides doivent être triés et exportés vers le bon compartiment cellulaire. Dans notre équipe, nous étudions comment les lipides sont transportés vers les différents compartiments grâce aux protéines de transfert de lipide et comment ils sont stockés dans les gouttelettes lipidiques. Pour cela, nous utilisons différents systèmes modèles, comme la levure bourgeonnante unicellulaire, des lignées cellulaires, ou des systèmes synthétiques de protéines et de lipides. Nous combinons une variété d’approches (bioinformatique, biologie moléculaire, biochimie, microscopie en fluorescence et méthodes biophysiques) pour décrypter les détails moléculaires de ces processus cellulaires fondamentaux.

  1. Le transfert de lipides se produit souvent dans les sites de contact membranaire, qui sont des régions d’apposition étroite entre les organites. Nous sommes particulièrement intéressés par l’homéostasie de la phosphatidylsérine (PS), qui est synthétisée dans le réticulum endoplasmique, mais qui est fortement enrichie dans le feuillet cytosolique de la membrane plasmique. Nous étudions comment la protéine Osh6, qui transfère la PS dans la membrane plasmique de la levure, coopère avec la protéine Ist2 qui est le facteur d’attachement du réticulum endoplasmique et de la membrane plasmique.
  2. Les gouttelettes lipidiques sont des organites ubiquitaires dont la taille très variable dépend du type de cellule, atteignant plus de 100 micromètres dans les adipocytes matures. Nous étudions une famille de protéines, les périlipines, qui tapissent abondamment la surface des gouttelettes lipidiques grâce à des hélices amphipathiques. Nous nous intéressons à la façon dont ces protéines contribuent au maintien de la taille et de la stabilité des gouttelettes lipidiques, en particulier dans les adipocytes.
Lab picnic, July 2024. From left to right: Alenka, Cyril Moulin, Céline, Bastien Brignola, Camille Syska, Ivan Fayol, Nicolas Fuggetta, Bayane Sabbagh, Sylvie Rouquier (collaboratrice)
Lab outing-Acrobranche, July 2023. From left to right: Nicolas Fuggetta, Alenka, Céline, guest, Charbel Choufani,  Bayane Sabbagh, Eva Sorokotiaga, Coralie Molina, Karolina Belingar.
Lab photo, Feb 2022. From left to right: Tinkara Perme, Charbel Choufani, Meryem Rezzik, Bayane Sabbagh, Céline Franckhauser, Maxime Bello, Alenka Čopič, Rokhaya Faye
Lab photo, April 2021. From left to right: Juan-Martin D’Ambrosio, Alenka Čopič, Nicolas-Frédéric Lipp
  • ANR “PlinAmylo” (2024-2028)
    Coordinator: Alenka Copic
    Partners: Luc Bousset (LMN, CNRS); Veronique Albanèse (IJM, CNRS); Albert Tsai (CRBM, CNRS)
  • AFM-Téléthon “AmyloMyo” (2024-2026)
    Coordinator: Alenka Copic
    Alessandra Ruggieri (Fondazione IRCCS Istituto Neurologico Carlo Besta, Milano); Andrey Kajava (CRBM, CNRS); Luc Bousset (LMN, CNRS)
  • ANR “PIPELINE” (2023-2027)
    Coordinator: Guillaume Drin, IPMC CNRS
    Partners: Alenka Copic;  J-M Brunel, MCT AMU
  • ANR « MixAndMove » (2021-2025)
    Coordinator: Alenka Copic
    Partners: Guillaume Lenoir (I2BC, U. Paris-Saclay);  Guillaume Drin (IPMC, CNRS); Luca Monticelli (IBCP, INSERM)
  • 9/2020 – 8/2027 ERC Synergy “Spheres” (2020-2027)
    PI’s: D. Langin, U. Toulouse; M. Ryden, Karolinska Inst.; B. Antonny, IPMC, CNRS)
    Independent partner: Alenka Copic

2024

  • Surface tension-driven sorting of human perilipins on lipid droplets. Dias Araújo AR, Bello AA, Bigay J, Franckhauser C, Gautier R, Cazareth J, Kovács D, Brau F, Fuggetta N, Čopič A, Antonny B. J Cell Biol. 2024 Dec 2;223(12):e202403064. Pubmed
  • Established and emerging players in phospholipid scrambling: A structural perspective. Sebinelli HG*, Syska C*, Čopič A, and Lenoir G. Biochimie 2024. in press (review article)
  • Molecular mechanisms of perilipin protein function in lipid droplet metabolism. Griseti E, Bello AA, Bieth E, Sabbagh B, Iacovoni JS, Bigay J, Laurell H, Čopič A. FEBS Lett. 2024;598(10):1170-1198. (review article). Pubmed

2023

  • Phosphatidylserine transport in cell life and death. Čopič A, Dieudonné T, Lenoir G.  Curr Opin Cell Biol. 2023 Aug;83:102192.. Pubmed

2021

  • Transport Pathways That Contribute to the Cellular Distribution of Phosphatidylserine. Lenoir G, D’Ambrosio JM, Dieudonné T, Čopič A.. Front Cell Dev Biol. 2021 Sep 1;9:737907. Pubmed
  • A comprehensive library of fluorescent constructs of SARS-CoV-2 proteins and their initial characterization in different cell types. Miserey-Lenkei S, Trajkovic K, D’Ambrosio JM, Patel AJ, Čopič A, Mathur P, Schauer K, Goud B, Albanèse V, Gautier R, Subra M, Kovacs D, Barelli H, Antonny B. Biol Cell. 2021 Jul;113(7):311-328. Pubmed
  • Exceptional stability of a perilipin on lipid droplets depends on its polar residues, suggesting multimeric assembly. Giménez-Andrés M, Emeršič T, Antoine-Bally S, D’Ambrosio JM, Antonny B, Derganc J, Čopič A. Elife. 2021 Apr 15;10:e61401.. Pubmed

2020

  • Osh6 requires Ist2 for localization to ER-PM contacts and efficient phosphatidylserine transport in budding yeast. D’Ambrosio JM, Albanèse V, Lipp NF, Fleuriot L, Debayle D, Drin G, Čopič A. J Cell Sci. 2020 Jun 4;133(11):jcs243733. Pubmed

2018

  • A giant amphipathic helix from a perilipin that is adapted for coating lipid droplets. Čopič A, Antoine-Bally S, Giménez-Andrés M, La Torre Garay C, Antonny B, Manni MM, Pagnotta S, Guihot J, Jackson CL. Nat Commun. 2018 Apr 6;9(1):1332. Pubmed
  • The Many Faces of Amphipathic Helices. Giménez-Andrés M, Čopič A, Antonny B. Biomolecules. 2018 Jul 5;8(3):45. Pubmed

2016

  • Membrane bending by protein crowding is affected by protein lateral confinement. Derganc J, Čopič A. Biochim Biophys Acta. 2016 Jun;1858(6):1152-9. Pubmed

2015

  • Phosphatidylserine transport by ORP/Osh proteins is driven by phosphatidylinositol 4-phosphate. Moser von Filseck J, Čopič A, Delfosse V, Vanni S, Jackson CL, Bourguet W, Drin G. Science. 2015 Jul 24;349(6246):432-6. Pubmed

Stockage et transfert des lipides dans la cellule


Alenka ČOPIČ

Cheffe d’équipe (Directrice de Recherche DR2 CNRS)

Membres de l’équipe

  • Sylvie ROUQUIER
    (Chercheur DR2) +33 (0)4 34 35 95 26
  • Alenka COPIC Chef d'équipe
    (Chercheur DR2) +33 (0)4 34 35 95 27
  • Celine FRANCKHAUSER
    (IE-Recherche) +33 (0)4 34 35 95 27
  • Bayane SABBAGH
    (Doctorant) +33 (0)4 34 35 95 26
  • Nicolas FUGGETTA
    (IE-Recherche) +33 (0)4 34 35 95 26
  • Camille SYSKA
    (Chercheur) +33 (0)4 34 35 95 26
  • Cyril MOULIN
    (Chercheur) +33 (0)4 34 35 95 26
  • Faiza KHARTOUCH
    (Stagiaire) +33 (0)4 34 35 95 26
  • Lena CAUSSE Autre
    (Stagiaire) +33 (0)4 34 35 95 26
  • Contactez notre équipe

    Remplacez le nom et l’adresse ci-dessus par celui du membre à contacter
    prenom.nom@crbm.cnrs.fr

    European Research Council (ERC) grant – European Academy         

    NOS PUBLICATIONS

    Surface tension-driven sorting of human perilipins on lipid droplets.

    Dias Araújo AR, Bello AA, Bigay J, Franckhauser C, Gautier R, Cazareth J, Kovács D, Brau F, Fuggetta N, Čopič A, Antonny B.

    J Cell Biol. 2024 Dec 2;223(12):e202403064

    Pubmed

    Exceptional stability of a perilipin on lipid droplets depends on its polar residues, suggesting multimeric assembly.

    Giménez-Andrés M, Emeršič T, Antoine-Bally S, D’Ambrosio JM, Antonny B, Derganc J, Čopič A.

    Elife. 2021 Apr 15;10:e61401.

    Pubmed

    A giant amphipathic helix from a perilipin that is adapted for coating lipid droplets. 

    Čopič A, Antoine-Bally S, Giménez-Andrés M, La Torre Garay C, Antonny B, Manni MM, Pagnotta S, Guihot J, Jackson CL.

    Nat Commun. 2018 Apr 6;9(1):1332.

    Pubmed